Câu chuyện về 1 cô gái tên Hanato Kobato, vừa mới dọn tới 1 chung cư ở Tokyo (chung cư này được quản lí bởi Chitose Hibiya, bây giờ là Chitose Mihara, nơi mà Hideki và Chii từng ở trong Chobits). Đi cùng với Kobato là chú chó bông màu xanh của cô. Nhìn bể ngoài thì nó là 1 con chó bông dễ thương nhưng thực sự nó rất rất rất là dễ sợ. Cả hai đi đến Tokyo để làm đầy cái chai của Kobato bằng cách chữa lành những vết thương trong trái tim hay nỗi phiền muộn lo lắng của người khác, chỉ phải chú ý một điều, không được trúng "mũi tên thần ái tình". Có 1 điều rất bí hiểm là Kobato không được bỏ mũ ra, nếu không cô sẽ gặp phải hậu quả.....